ورم ملتحمه‌ی آلرژیک مانند تمام آلرژی‌ها زمانی شروع می‌شود که سیستم ایمنی یک ماده‌ی بی‌خطر را آلرژن شناسایی می‌کند. این باعث می‌شود سیستم ایمنی‌تان واکنش نشان داده و آنتی بادی‌هایی تولید کند که موجب واکنش آلرژیک می‌شوند.